系统发育树的构建及后期编辑

又到育树系统人家1) FFAST构树后面后用名字编辑2) C下载点击如下 到了研究生树。索性就做统发育树如家怎么分析FASTA 格式TA是最为常树之前先将面可以接序用空格结束字的前10个辑后的序列Clustal X进行载此软件，击第一行最后下图： 系统生写毕业论文做一个图文何看等理论析系统发育树式序列文本 常用的序列将所选的序列序列描述性语束，这就是一个字符不要见下图： 行多序列比解压之后直后一个图标，统发育树文的时候了文的帖子，方论性问题。树的。 列格式，几乎列都粘贴在语言，比如一个FASTA格要完全相同。比对 直接用。解然后点击fil的构建及，这几天两方便大家。纯要问的话，乎所有序列分在一个txt文属名，种名格式的序列。为了方便解压图如下：e，load seq及其后期编两个师妹相继纯技术贴，不送一句话，分析软件都文本文件中，名等。然后换列了。需要注便起见，最好 uence，选择编辑 继让我教他不涉及建树，自己多找都能识别这种，然后每条序换行粘贴序注意的一点好将此文件择正确路径。他们构建系统树序列的选择找几篇文章看种格式的序序列以 开序列，序列的点是每条序列件放在桌面上加载进来的统发择、看看序列。开头，的最列的上。  序列 点击这时结果然后用来3) a打开选择击比对，进行时将路径改为果如下图 (注后注意桌面上来进行后续工aln 格式转化开MEGA4.0，择路径，将a行完全比对。为桌面，点击对意区别)： 上多了两个文工作。关掉cl化为MEG格点击file，cln格式文档加这时会弹出对齐进行全序文件，一个是ustalX窗口即格式 convert to ME加载进来，点一个对话框，序列比对，序dnd格式的即可。 EGA format，点击OK，出，如下： 序列较多的话，一个是aln出现如下对现下图： 话可能需要点n格式的。A对话框：  点时间。比对Aln格式的文对后的件将    点击4) M关掉MEG废话关掉做下 5) 开原理phy击保存，会发MEG文档的掉这些窗口，GA4.0，这时话一句：核酸掉这个界面，下对比)： 开始建树(N理不讲了，ylogeny，ne发现在桌面上的激活 回到MEGA会出现如下对序列比对选核此时该MEGNJ tree) 此处以构eighbor join上又多了一个刚打开时的对话框： 核酸序列，氨G文档已被激建NJ树为ning (NJ).出现文档，看其属样子，将刚生氨基酸序列比激活，处于待为例。点击现如下界面属性会发现是生成的那个 比对选氨基酸待用状态，如击工具栏上面(注意几个是MEG格式MEG文档用酸序列。点击如下 (可以和上的phyloge个绿颜色的小式的，OK。 用拖拽的方式OK，出现如MEGA初始eny，const小方块)： 拖进下：  界面 truct 点击 选择时候择P(Kim可以击第一个小绿择Bootstrap，候对于蛋白质Poisson Corrmura‐2参数) 以对此树做出绿方块，选择后面的rep质序列以及Drection (泊松模型。所有出一些修改，择，小绿方块lication改为DNA序列，两松修正)这一模有设置完毕之比如线条粗会变成四个点为1000，点击两者模型的选模型。而对于后，点击co细，树的形状点的省略号，击对勾。然后选择是不同的于核酸序列，ompute，雏形 状等等，此处，再点击出现后点击第三个的。对于蛋白多选择Kim形的树就出来处自己多试试 现如下页面：个小绿方块，白质的序列，mura 2‐param来了： 试。  这个多选meter 6)树建好的要 在图  这个下图树的修饰 好树之后，往要求。点击im图上点击右键个时候可以通图： 往往需要对树mage，copy t键，就可以对通过Adobe pr树做一些美化to clipboard。对文字的字体rofessional 对。这个工作完。新建一个w大小，倾斜等对其进行图像完全可以在wword文档，等做出修饰。像导出：先将word中完成选择粘贴。见。见下图： 将此word文档成，达到发表见下图： 档打印成PDF表文章  F，见 将打此时 选择打印出来的P时，点击 工具择需要的区域DF保存在桌具，高级编辑域以删除周围桌面上，打开辑工具，裁剪围的空白区，开，如下图：剪工具，如下双击发育树，下图所示：，会出现下图  图：  点击 点击这个击确定，出现击文件，另存个图片绝对可现下图 (把空边存为，在保存可以满足文章边切掉了)：存类型一栏中章的发表：  选择 TIFF格格式，点击确确定后会生成成下面这个图  片，  OK， game over.